Nieprawidłowa faktura w KSeF? 5 kroków, które warto podjąć

Szymon Lipiński | Senior Tax Consultant | Crowe Polska
24.07.2026
Nieprawidłowa faktura w KSeF? 5 kroków, które warto podjąć

Błędnie lub fikcyjnie wystawiona faktura może trafić do KSeF również do Twojej firmy. Wyjaśniamy, co oznacza taka sytuacja, czego nie robić i jakie działania warto podjąć, aby uniknąć problemów podczas kontroli podatkowej.

Crowe Polska

Dlaczego w KSeF może pojawić się nieprawidłowa faktura?


Krajowy System e-Faktur identyfikuje odbiorcę wyłącznie na podstawie numeru NIP. System weryfikuje poprawność techniczną przesyłanego pliku, ale nie sprawdza, czy transakcja rzeczywiście miała miejsce ani czy wskazany nabywca jest właściwy.

W praktyce oznacza to, że do KSeF mogą trafić faktury wystawione:

  • wskutek pomyłki przy wpisywaniu numeru NIP,
  • omyłkowo przez wystawcę,
  • w wyniku nadużycia lub celowego działania.

Co istotne, odbiorca nie ma możliwości odrzucenia faktury. Po nadaniu numeru KSeF dokument uznawany jest za skutecznie wystawiony i doręczony.

Doradztwo KSeF

Doradztwo podatkowe

Czy otrzymanie fałszywej faktury oznacza obowiązek zapłaty?


Nie. Samo pojawienie się faktury w KSeF nie powoduje powstania obowiązku zapłaty ani obowiązku podatkowego. Jeżeli transakcja nie została zawarta, przedsiębiorca:

  • nie ma obowiązku zapłaty wynikającej z niej kwoty,
  • nie powinien odliczać VAT,
  • nie powinien ujmować jej w kosztach ani księgach rachunkowych.

Ryzyko pojawia się dopiero wtedy, gdy dokument zostanie błędnie zaksięgowany lub wykorzystany do rozliczeń podatkowych.

Co zrobić po otrzymaniu podejrzanej faktury w KSeF?


1. Nie księguj dokumentu

Do czasu wyjaśnienia sprawy faktura nie powinna zostać:

  • ujęta w ewidencji VAT,
  • zaksięgowana,
  • skierowana do płatności,
  • uwzględniona w rozliczeniach podatkowych.
  • Najlepiej oznaczyć ją w systemie finansowo-księgowym jako dokument wymagający wyjaśnienia.

    2. Zweryfikuj, czy transakcja rzeczywiście nie miała miejsca

    Przed uznaniem faktury za fikcyjną warto sprawdzić, czy:

    • zakup nie został zrealizowany przez inny dział,
    • nie doszło do zawarcia umowy poza standardowym procesem zakupowym,
    • nie jest to zwykła pomyłka przy wystawianiu dokumentu.

    3. Zabezpiecz dokumentację

    Warto pobrać z KSeF:

    • fakturę,
    • numer KSeF,
    • dane wystawcy,
    • datę wystawienia,
    • metadane dokumentu.

    Dobrą praktyką jest również sporządzenie wewnętrznej notatki potwierdzającej, że transakcja nie miała miejsca.

    4. Skontaktuj się z wystawcą

    Jeżeli przyczyną jest pomyłka, wystawca powinien wystawić fakturę korygującą.

    W wielu przypadkach problem wynika z błędnie wpisanego numeru NIP i może zostać szybko wyjaśniony.

    5. Rozważ zawiadomienie urzędu skarbowego

    Jeżeli kontakt z wystawcą jest niemożliwy lub istnieje uzasadnione podejrzenie, że dokument został wystawiony celowo niezgodnie ze stanem faktycznym, warto poinformować właściwy urząd skarbowy.

    Takie działanie potwierdza dochowanie należytej staranności i może ograniczyć ryzyko nieporozumień podczas ewentualnych czynności sprawdzających.

    Crowe Polska

    Czy KAS może zainteresować się taką fakturą?


    Tak. Systemy analityczne Krajowej Administracji Skarbowej automatycznie porównują dane wykazywane przez sprzedawców i nabywców. Brak zgodności pomiędzy wykazanym podatkiem należnym a naliczonym może skutkować czynnościami sprawdzającymi lub kontrolą.

    Dlatego warto posiadać dokumentację potwierdzającą, że dana faktura nie odzwierciedla rzeczywistej transakcji oraz że nie została ujęta w rozliczeniach.

    Co grozi wystawcy fikcyjnej faktury?


    Nieprawidłowa faktura w KSeF? 5 kroków, które warto podjąć

    Konsekwencje mogą być bardzo dotkliwe.

    Zgodnie z art. 108 ustawy o VAT osoba, która wystawi fakturę z wykazanym podatkiem VAT, co do zasady ma obowiązek jego zapłaty, nawet jeśli transakcja nie miała miejsca.

    Dodatkowo mogą zostać nałożone:

    • dodatkowe zobowiązanie podatkowe wynoszące nawet 100% wykazanego VAT,
    • odpowiedzialność karna skarbowa,
    • odpowiedzialność karna za wystawienie tzw. pustych faktur, obejmująca wysokie grzywny, a w najpoważniejszych przypadkach również karę pozbawienia wolności.

    Jak przygotować firmę na takie sytuacje?


    Obowiązkowy KSeF to nie tylko zmiana sposobu fakturowania, ale również konieczność dostosowania procedur kontrolnych.

    Warto już dziś wdrożyć wewnętrzne zasady dotyczące:

    • weryfikacji faktur przed ich zaksięgowaniem,
    • identyfikowania dokumentów budzących wątpliwości,
    • postępowania w przypadku błędnie wystawionych faktur,
    • dokumentowania podjętych działań,
    • komunikacji z kontrahentami i organami podatkowymi.

    Dobrze przygotowane procedury pozwalają ograniczyć ryzyko podatkowe oraz sprawniej przejść ewentualne czynności sprawdzające.

    Masz pytania dotyczące KSeF lub rozliczeń VAT?

    Nasi doradcy podatkowi pomagają przedsiębiorcom we wdrożeniu KSeF, analizie ryzyk podatkowych oraz opracowaniu procedur ograniczających ryzyko błędów.

    Szymon Lipiński
    Szymon Lipiński
    Senior Tax ConsultantCrowe Polska

    Zobacz także: