Các quan điểm của cơ quan thuế về việc áp dụng ưu đãi thuế TNDN đối với doanh nghiệp FDI
Luật Thuế thu nhập doanh nghiệp năm 2025, Nghị quyết số 198/2025/QH15 và các văn bản hướng dẫn đã bổ sung nhiều chính sách ưu đãi thuế nhằm hỗ trợ hoạt động đầu tư và phát triển doanh nghiệp.
Trong quá trình triển khai các chính sách này, đặc biệt đối với doanh nghiệp có vốn đầu tư nước ngoài (FDI), một số cơ quan thuế đã có các hướng dẫn khác nhau liên quan đến việc xác định điều kiện và phạm vi áp dụng ưu đãi thuế TNDN.
Để hỗ trợ doanh nghiệp theo dõi quan điểm của cơ quan thuế, Crowe Vietnam tổng hợp một số văn bản đáng chú ý liên quan đến việc áp dụng ưu đãi thuế TNDN đối với doanh nghiệp FDI như sau:
| Cơ quan thuế / Văn bản | Nội dung hướng dẫn | Cơ sở lập luận |
| Thuế TP. Hồ Chí Minh: Công văn số 4128/TPHCM-QLDN3 ngày 21/4/2026 | Doanh nghiệp có vốn đầu tư nước ngoài (FDI), mặc dù đáp ứng tiêu chí doanh nghiệp nhỏ và vừa, không thuộc đối tượng được miễn thuế TNDN trong 03 năm theo Nghị quyết 198/2025/QH15 và Nghị định 20/2026/NĐ-CP. | Căn cứ mục tiêu của Nghị quyết số 198/2025/QH15 về phát triển kinh tế tư nhân, từ đó cho rằng chính sách miễn thuế không áp dụng đối với doanh nghiệp FDI. |
| Cục Thuế: Công văn số 3896/CT-CS ngày 11/6/2026 | Khẳng định doanh nghiệp FDI vẫn được miễn thuế TNDN trong 03 năm nếu được thành lập theo pháp luật Việt Nam, được cấp Giấy chứng nhận đăng ký doanh nghiệp lần đầu, đáp ứng tiêu chí doanh nghiệp nhỏ và vừa và không thuộc các trường hợp bị loại trừ tại điểm b khoản 3 Điều 7 Nghị định 20/2026/NĐ-CP. | Căn cứ Nghị quyết số 198/2025/QH15, Nghị định số 20/2026/NĐ-CP, Luật Hỗ trợ doanh nghiệp nhỏ và vừa và Luật Doanh nghiệp; các quy định này không phân biệt doanh nghiệp trong nước và doanh nghiệp có vốn đầu tư nước ngoài khi xác định đối tượng được hưởng ưu đãi. |
Quan điểm của Crowe Vietnam
Qua các văn bản nêu trên, có thể thấy trong giai đoạn đầu triển khai Nghị quyết số 198/2025/QH15 và Nghị định số 20/2026/NĐ-CP đã xuất hiện những cách hiểu khác nhau liên quan đến việc áp dụng các chính sách ưu đãi thuế TNDN đối với doanh nghiệp có vốn đầu tư nước ngoài (FDI).
Đáng chú ý, Công văn số 3896/CT-CS ngày 11/6/2026 của Cục Thuế đã làm rõ rằng yếu tố vốn đầu tư nước ngoài không phải là căn cứ để loại trừ doanh nghiệp khỏi đối tượng được miễn thuế TNDN 03 năm theo Nghị quyết số 198/2025/QH15. Theo đó, doanh nghiệp FDI được thành lập theo pháp luật Việt Nam vẫn có thể được hưởng ưu đãi nếu đáp ứng đầy đủ các điều kiện theo quy định.
Đồng thời, một số văn bản của cơ quan thuế địa phương trước đây cho thấy xu hướng xem xét tương đối chặt chẽ đối với doanh nghiệp FDI khi áp dụng các chính sách ưu đãi thuế. Do đó, doanh nghiệp không nên chỉ tập trung vào yếu tố sở hữu vốn nước ngoài mà cần rà soát đầy đủ các điều kiện về doanh nghiệp nhỏ và vừa, tình trạng thành lập mới và các trường hợp loại trừ theo Điều 7 Nghị định số 20/2026/NĐ-CP.
Đối với các doanh nghiệp đã nhận được hướng dẫn khác từ cơ quan thuế địa phương trước đây, doanh nghiệp có thể tham chiếu Công văn số 3896/CT-CS khi trao đổi với cơ quan thuế quản lý trực tiếp nhằm đảm bảo việc áp dụng ưu đãi phù hợp với quy định hiện hành.
>>> Tải Công văn số 4128/TPHCM-QLDN3
>>> Tải Công văn số 3896/CT-CS